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发源于福建、江西交界的建宁县均口镇。建溪、富屯溪、沙溪三大主要支流在南平市附近汇合后称闽江。穿过沿海山脉至福州市南台岛分南北两支,至罗星塔复合为一,折向东北流出琅岐岛注入东海。干支流流经38个县市(浙江省境内有龙泉和庆元两县,福建省境内有福州、三明、南平、莆田4个市和建宁、宁化、清流、长汀、连城、明溪、沙县、泰宁、将乐、光泽、顺昌、武夷山、建阳、建瓯、浦城、松溪、政和、永安、邵武、大田、尤溪、漳平、屏南、古田、德化、永泰、仙游、福清、闽清、闽侯、长乐、连江等30个市县),流域面积60992平方公里,其中省内流域面积59922平方公里,约占全省陆域面积一半,水系河流总长6107公里,多年平均径流量575.79亿立方米。